1998年3月6日，經中國證監會批準，南方基金作為國內首批規范的基金管理公司正式成立，成為我國“新基金時代”的起始標志。
2018年1月，公司整體變更設立為南方基金管理股份有限公司，注冊資本為3億元人民幣，股本總額為3億股。發起人持股比例為:華泰證券股份有限公司持股45％，深圳市投資控股有限公司持股30％，廈門國際信托有限公司持股15％，興業證券股份有限公司持股10％。
目前，公司在北京、上海、合肥、成都、深圳、南京等地設有分公司，在深圳前海和香港設有子公司——南方資本管理有限公司（深圳子公司）和南方東英資產管理有限公司（香港子公司）。其中，南方東英是境內基金公司獲批成立的第一家境外分支機構。
公司擁有一支高素質、經驗豐富的專業化團隊。截至2017年上半年末，公司共有員工553人，超過70%的員工具有碩士以上學歷，近55%的員工具有5年以上的證券從業經歷，其中投研人員的平均證券從業年限近7年，30%的投研人員具有海外學習或工作經驗。
公司經歷了中國證券市場多次牛熊交替的長期考驗，以持續優秀的投資業績、完善周到的客戶服務，贏得了廣大基金投資人、社保理事會、企業年金客戶、專戶客戶的認可和信賴。在多年的發展中，公司相繼獲得包括公募基金、專戶理財、社�；�、企業年金、保險資金、基本養老保險基金等在內的公募基金行業全牌照。截至2017年上半年末，南方基金母子公司合并資產管理規模9185億元。其中南方基金資產管理規模6586億元，位居行業前列。南方基金旗下管理公募基金共134只，產品涵蓋股票型、混合型、指數型、避險策略型、債券型、貨幣型、QDII、FOF等，公募基金規模3765億元，在全國113家基金公司中排名第5，累計向基金持有人分紅超過847億元，擁有客戶數量超過3300萬人；南方基金非公募業務管理規模2821億元，在行業中持續保持領先地位。南方資本專戶子公司資產管理規模2272億元，南方東英香港子公司資產管理規模317億元。南方基金已經發展成為國內產品種類豐富、業務領域全面、客戶數量龐大、經營業績優秀、資產管理規模最大的基金管理公司之一。
